ময়মনসিংহে পানি সেচের জন্য ১৯৩৮ খ্রীস্টাব্দে প্লাবনের পরে পূর্বে বাংলার বন্যা নিয়ন্ত্রণের উপর কলকাতা বিশ্ববিদ্যালয় কর্তৃক একটি সেমিনার আহ্বান করা হয়। এই সেমিনারের সুপারিশক্রমে তৎকালীন বেঙ্গল গভর্ণমেন্ট ময়মনসিংহ জলসেচের একটি বিভাগীয় অফিস স্থাপন করেন এবং জে.কে সরকার এই সেচ বিভাগের প্রথম নির্বাহী প্রকৌশলী হিসেবে যোগদান করেন। ১৯৩৯ খ্রিস্টাব্দে এ বিভাগের আওতায় পুরাতন ব্রহ্মপুত্র নদের নদী শাসন কাজ বাস্তবায়ন করা হয়।
১৯৫৪ এবং ১৯৫৫ সালে সমগ্র বাংলাদেশে উপর্যুপুরি ভয়াবহ বন্যার পর বন্যার ক্ষয়ক্ষতি কমিয়ে খাদ্য উৎপাদন বাড়ানোর লক্ষ্যে ১৯৫৭ সনে জাতিসংঘের অধীনে গঠিত ক্রুগ মিশন এর সুপারিশক্রমে তৎকালীন সমগ্র পূর্ব পাকিস্থানের (বর্তমান বাংলাদেশ) পানি সম্পদ ব্যবস্থাপনা ও উন্নয়নের লক্ষ্যে ১৯৫৯ সনে পূর্ব পাকিস্থান পানি ও বিদ্যুৎ উন্নয়ন কর্তৃপক্ষ (ইপিওয়াপদা) গঠন করা হয়। তখন ইপিওয়াপদা এর আওতায় এতদঅঞ্চলের বন্যা নিয়ন্ত্রণ, সেচ উন্নয়ন ও নদীতীর সংরক্ষণসহ পানি সম্পদ উন্নয়নের নিমিত্তে ময়মনসিংহে বিদ্যমান পানি উন্নয়ন বিভাগ এর কলেবর বৃদ্ধি করা হয় এবং মোঃ আলতাব উদ্দীন আহম্মদ ২৫-০৬-১৯৬০ তারিখে পূর্ণগঠিত এ বিভাগের প্রথম নির্বাহী প্রকৌশলী হিসেবে যোগদান করেন। স্বাধীনতার পর ১৯৭২ সালে তৎকালীন মহামান্য রাষ্ট্রপতির আদেশ নং ৫৯ মোতাবেক ইপিওয়াপদা এর পানি অংশ একই ম্যান্ডেট নিয়ে বাংলাদেশ পানি উন্নয়ন বোর্ড নামক সম্পূর্ণ স্বায়ত্বশাসিত সংস্থা গঠিত হলে উক্ত সংস্থার আওতায় বৃহত্তর ময়মনসিংহ জেলায় সেচ, বন্যা নিয়ন্ত্রণ ও নদী শাসন কাজসহ পানি সম্পদ উন্নয়ন কাজ বাস্তবায়নের দায়িত্ব এ বিভাগের উপর অর্পিত হয়।
বৃহত্তর ময়মনসিংহে জেলার পানি সম্পদ উন্নয়ন সংক্রান্ত কাজ মনিটরিং, সুষ্ঠরুপে তদারকী ও দায়িত্ব পালনের জন্য ময়মনসিংহ শহরে পানি উন্নয়ন বোর্ডের আওতায় একটি সার্কেল প্রতিষ্ঠিত হয়। পরবর্তীতে বৃহত্তর ময়মনসিংহের সবগুলো নবগঠিত জেলায় একটি করে পানি উন্নয়ন বিভাগ স্থাপিত হয় এবং সর্বশেষ ২০১১ খ্রিস্টাব্দে ময়মনসিংহ পানি উন্নয়ন বিভাগ হতে বিভক্ত হয়ে কিশোরগঞ্জ পানি উন্নয়ন বিভাগ প্রতিষ্ঠিত হয়। বর্তমানে এ সার্কেলের আওতায় ময়মনসিংহ পওর বিভাগসহ , জামালপুর পওর বিভাগ, নেত্রকোনা পওর বিভাগ ও কিশোরগঞ্জ পানি উন্নয়ন বিভাগের কার্যক্রম পরিচালিত হচ্ছে। এতদ্ব্যতীত এতদঅঞ্চলের ভূ-গর্ভস্থ পানির পরিমাপ সংক্রান্ত তথ্যাদি নিয়মিত সংগ্রহ, প্রসেসিং, গবেষণা ও সংরক্ষণের জন্য বাংলাদেশ পানি উন্নয়ন বোর্ডের আওতায় একটি মরফোলজি বিভাগ ও একটি হাইড্রোলজি উপ-বিভাগের দপ্তর রয়েছে। তাছাড়াও বৃহত্তর ময়মনসিংহ জেলায় বাংলাদেশ পানি উন্নয়ন বোর্ডের আওতায় কৃষি সম্প্রসারনের লক্ষ্যে উপ-প্রধান সম্প্রসারণ কর্মকর্তার একটি দপ্তর রয়েছে।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস